سی و نه داستان سه دوست را روایت می کند که در کلاس یازدهم دبیرستان با هم آشنا شدند. آنها چا می جو (Son Ye Jin)، جونگ چان یانگ (Jeon Mi Do) و Kim Ji Hyun (Jang Joo Hee) هستند. از لحاظ ظاهری به نظر نمی رسد که آنها اکنون 39 ساله هستند و در زندگی با یکسری مشکلات روبرو هستند.

سو جونگ وون یک مجری محبوب و همچنین گزارشگر تحقیقاتی است که سعی می کند تخلفات مجرمان را به روش خودش افشا کند. او متهم به قتل معشوقه همسرش می شود. سو جونگ وون سعی می کند به کمک کارآگاه کیم ته هون حقیقت را آشکار کند…

یک پرستار مهربان که در روانپزشکی کار می کند، علیرغم چالش های پیش رو، سعی می کند روزانه پرتوی از نور را برای کسانی که تحت مراقبت هستند فراهم کند،در همین حین، او دنیای سلامت روان و داستان های متنوع پیرامون آن را مرور می کند.