گروهی شبه نظامی به نام "E.S.W.A.T" در آرمانشهری به نام "المپوس" به همراه انسانها،سایبورگها و انسانهای مهندسی شده تلاش می کنند زندگی کاملی در کنار یکدیگر داشته باشند.اما تعدادی حمله تروریستی که توسط سایبورگها و انسانها انجام می شود شهر را دچار آشوب می کند...

نینجاها در سرتاسر تمام کشورها ناپدید میشوند و همه ملت آتش رو مقصر میدانند. به دستور سوناده، کاکاشی قربانی میشود تا جلوی جنگی همه جانبه گرفته شود....

ناروتو، شیکامارو و ساکورا این بار به مأموریتی فرستاده شده‌اند تا حیوان دست‌آموز گمشده‌ای را به دهکده‌اش بازگردانند اما با جنگجوی اسرارآمیزی مواجه می‌شوند که...

یک پزشک و بیمارش که اخیراً درگذشته اند، به عنوان دوقلویی بسیار معروف ژاپنی که در صنعت موسیقی فعالیت میکردند دوباره متولد میشوند،آنها همانطور که به مرور زمان رشد میکنند، با فراز و نشیب های این صنعت سرگرمی ژاپن دست و پنجه نرم میکنند....