ناروتو و ساکورا در دنیایی موازی توسط مادارا اسیر می شوند که قصد دارد نه دم را از ناروتو بدزدد...

نبرد ناروتو برای اثبات بی گناهی خویش ، ناروتو برای جرمی که مرتکب نشده مجرم شناخته می‌شود و برای اصلاح به زندان فرستاده می‌شود و…

یک گروه مرموز از نینجاها به نام سو-نین که از کشور آسمان هستند به شهر کونوها حمله می‌کنند و…

نینجاها در سرتاسر تمام کشورها ناپدید میشوند و همه ملت آتش رو مقصر میدانند. به دستور سوناده، کاکاشی قربانی میشود تا جلوی جنگی همه جانبه گرفته شود....

در اوایل قرن بیستم، سوگیموتو( فناناپذیر ) سایچی کهنه سرباز جنگ ،در عصر طلایابی در حیات وحش هوکایدو، طلای ناچیزی را برای خودش مشخص می‌کند. وقتی که به نقشه‌ی یک گنج برمی‌خورد....

داستان فردی به نام کازو که در کافی شاپی برای خانواده کار می‌کند. در آنجا اعتقادی وجود دارد که کسی که پشت میزی به خصوص بنشیند، می‌تواند در زمان سفر کند و همچنین می‌توان مقصد خود را نیز خود انتخاب کند.