داستان سریال «بچه جایگزین» در شهر نیویورک خیالی جریان دارد، جایی که آپولو کاگوا که یک فروشنده کتاب های دست دوم است، عاشق زنی به اما ولنتاین می شود، اندکی پس از به دنیا آمدن فرزند اول این زوج، در پی یک اتفاق وحشتناک، فرزند آنها ربود شده و ام نیز مفقود می شود، حال آپولو باید با هر ابزاری که می تواند در این جادویی به دنبال همسر و فرزندش بگردد...