زمانی که هایوگا هانابی توسط بیگانه های اوتسوتسوکی تونری ربوده می شود ، ناروتو برای نجات وی دست به کار می شود. اما…

یک گروه مرموز از نینجاها به نام سو-نین که از کشور آسمان هستند به شهر کونوها حمله می‌کنند و…

داستان این قسمت در جایی آغاز می شود که ناروتو در حال انجام دادن یک سری از تمرین های بسیار سخت می باشد که بر اثر یک اتفاق نادر بک گذشته سفر می کند پس از اینکه ناروتو با از سر گذراندن اتفاقات بسیاری متوجه می شود که به گذشته رفته است وارد شهری به نام لوران می شود در این شهر او او متوجه می شود که...

روح قدرتمندی که زمانی جهان را تهدید به نابودی می کرد، بازگشته است! ماموریت ناروتو محافظت از یک کشیش به نام شیون است که تنها کسی است که می تواند هیولا را مهر و موم کند.