گربه چکمه پوش متوجه می شود که اشتیاق او به ماجراجویی تاثیر خود را گذاشته است: او 8 زندگی از 9 زندگی خود را سوزانده است. گربه چکمه پوش سفری حماسی را آغاز می کند تا آخرین آرزوی افسانه ای را بیابد و زندگی نه گانه خود را بازسازی کند.

این انیمیشن داستان زندگی شخصیت گربه ی شمشیرزن سری انیمیشن های «شرک» را به تصویر می کشد. ماجراهایی که نهایتا او را به سمت شرک و دوستانش هدایت می کند.

پس از پر شدن باتلاقش از موجودات جادویی، یک غول موافقت می کند که یک شاهزاده خانم را نجات دهد و زمین خود را پس بگیرد.

والدین پرنسس فیونا، او و شرک را به صرف شام دعوت می کنند تا عروسی آن‌ها را جشن بگیرند، غافل از اینکه این زوج جوان، هر دو غول هستند.

چهار حیوان که دیگر از بودن در باغ وحش خسته شده‌اند، تصمیم به فرار می گیرند و به طور ناخواسته با چهار پنگوئن همراه میشوند. بعد از گذراندن ماجراهایی، آن‌ها خود را در ماداگاسکار می یابند.

یک نوزاد کت و شلوار پوشیده و کیف‌دار با برادر 7 ساله‌اش جفت می‌شود تا از توطئه شرم‌آور مدیرعامل شرکت توله‌سگ جلوگیری کنند.

پنگوئن های ماداگاسکار مثل قبل ماموریتی را در پیش رو دارند و باید جلوی کسی را که قصد دارد دنیا را نابود کند، بگیرند.

شرک به جشن هالووینی دعوت می شود که در آن مسابقه ای در جریان است. مسابقه از این قرار است که افراد باید با تعریف داستان های ترسناک یکدیگر را بترسانند. ولی پس از مدت کوتاهی شرک و دوستانش متوجه می شوند که مجبورند شب را در قلعه جن زده «لرد فارکواد» بمانند و تا زمانی که برنده مسابقه تعیین نشده است کسی نمی تواند از قلعه خارج شود…

یک ملاح ایرانی به نام سندباد در تلاش برای یافتن کتاب جادویی صلح , یک اثر مرموز است که Eris , الهه فاسد یونانی هرج و مرج , در نهایت او را برای دزدی تعیین کرده‌است ! اگر او در این جستجو موفق نشود , دوست دوران کودکی او پرنس Proteus از سیراکوز مجازات اعدام را به دست خواهد آورد در حالی که Eris جایگاه مطلوب قدرت

حیوانات قصد دارند به باغ وحش نیویورک بازگردند، اما با سقوط هواپیما در طبیعت وحشی آفریقا، آن‌ها با حیواناتی از نوع خودشان آشنا میشوند، و الکس والدینش را ملاقات میکند.

چهار حیوان به نامهای «آلکس (شیر)»،«مارتی (گورخر)»،«ملمن (زرافه)» و «گلوریا (اسب آبی)» در قسمت جدید هم در تلاش هستند تا به باغ وحش نیویورک برگردند و در راه برگشت در حالی که از اروپا می گذرند برای اینکه کمتر جلب توجه کنند،‌ به یک سیرک سیار می پیوندند...